תחרות זו מיועדת לתלמידי כיתות יב המתמחים בפרויקט הגמר "יישומים בביוטכנולוגיה" ברמה של חמש יחידות לימוד. הפרויקט הוא מחקר יישומי ועדכני המתבצע במוסד אקדמי וכולל התנסות מעשית של התלמידים.
השלב הראשון של האולימפיאדה הוא עם תחילת שנת הלימודים בכיתה יב. בשנה זו כל תלמידי התיכונים לפרויקט הגמר "יישומים בביוטכנולוגיה" ונבחנים בבחינה כללית. מתוכם נבחרים התלמידים שהגיעו להישגים הגבוהים ביותר בחברי כיתתם. תלמידים אלה מעפילים לשלב השני של התחרות, שלב הצגת עבודת הגמר בכרזה מדעית, בפני ועדה ארצית של צוות הפיקוח בביוטכנולוגיה. צוות הפיקוח בוחר את חמש העבודות הטובות ביותר שהוצגו בפניו, וכותביהן מעפילים לשלב הגמר.
באולימפיאדה מציגים הפיינליסטים את עבודתם בפני ועדת שיפוט. חברי הוועדה: פרופ' אילת פישמן ופרופ' עומר יחזקאלי, הפקולטה להנדסת ביוטכנולוגיה ומזון בטכניון, ויהודית דסקלו, מפמ"רית ביוטכנולוגיה. הזוכים בשלושת המקומות הראשונים יקבלו מלגות לימודים בטכניון.
קהל התלמידים המוזמנים לתחרות האולימפיאדה בטכניון שומע הרצאות מחזית המדע מטובי המרצים מהטכניון.
תחרות "הכרזה המדעית"
באירוע הגמר מוצגת תערוכה של כרזות מדעיות שהוצגו בשלב השני של התחרות. צוות שופטים בוחר שלוש כרזות מדעיות מצטיינות. בעבור הכרזה המדעית יקבלו הזוכים את מלוא הנקודות מהמורה ומהבוחן.